Le CESA 22 est animé par un Comité de Pilotage. Il comprend 19 personnes dont un président. Ils sont tous salariés et dépendent tous des conventions collectives concernées.
Le Comité de Pilotage se réunit au moins une fois par trimestre. Lors des réunions, il étudie, propose les prestations et produits que peut offrir le CESA. C'est au Bureau de l'ANEFA 22 que revient la responsabilité de valider ou non les propositions.